三叉神經痛病人疼痛發作的部位，局限于三叉神經分布區域內，不超越三叉神經的分布范圍。疼痛多為一側性，最多見為一側的第二、三支分布區域痛，其次為第二或第三支分布區域單獨疼痛，以第二支最常見，第三支次之，單獨第一支分布區域痛者很少見，約占2%-5%。有人認為，其原因在胚胎發育時第一支與第二、三支分別有兩個神經節發育而來。

　　疼痛可局限于一支的分布區域內，或僅限于一支的部分分布區域內。也可同時侵犯二支，但三支同時受侵犯者不多。少數可為雙側(約占3%)。但也不是同時發病，往往一側首先發病，經過一時期后，另一側才出現癥狀，即使雙側同時發病也各有其發作周期，或一側疼痛較為嚴重，一側交情，而且并非同時發作。疼痛多沿神經分支的走行分布，如第一支的疼痛的部位往往在眼的表淺或深處、上瞼及前額。第二支疼痛部位在頰部、上唇和齒齦，而硬腭疼痛者很少見。第三支的疼痛部位在下唇、齒齦，涉及舌部者較少。第二和第三支的疼痛可沿其分支向顳部房舍，比較有規律性。疼痛也可較長時間局限于一支分布區域。疼痛的擴散不呈跳躍式，如第三支痛不會越過第二支而到第一支痛。疼痛亦不越過中線，即使雙側患者，一側發作時也不越過對側。